撰写论文27篇，在国家级杂志发表11篇。参与撰写《肺功能测定原理和临床应用》、《结核病学》等著作共约12万余字。
作为第一作者，获北京市卫生局科技成果奖四项，中国防痨协会防痨科技成果优秀论文三等奖一项
李琦在重症患者肺换气功能监测吸入气体在肺内的分布肺部疾病患者心肺相互作用的研究脉冲震荡法测定肺癌患者的呼吸力学及运动心肺功能试验在评估肺癌外科手术适应证中的应用等研究中做出一定成绩作为课题负责人独立立题和组织实施6项课题其中两项课题分别获北京市优秀青年知识分子培养基金北京市跨世纪人才工程专项基金的资助
在重症患者肺换气功能监测
吸入气体在肺内的分布
作为课题负责人
